A szertartáson csak a család és a közeli barátok voltak jelen, beleértve Barbarát, a teniszező volt feleségét, fiainak édesanyját. Jelenleg egy luxusjacht fedélzetén tartózkodnak a Francia Riviérán. Boris fiai, a 15 éves Noah és a 9 éves Elias is részt vesznek az úton.

A két sztár még 2005-ben kezdett el találkozgatni egymással, majd 2008-ban rövid időre szakítottak. A teniszcsillagnak eközben volt egy rövid viszonya Alessandra Meyer Wöldennel, akit el is jegyzett, de később felbontotta és visszatért Lillyhez.

A többször Grand Slam - győztes teniszcsillag kedveli a színesbőrű hölgyeket, korábbi kapcsolatai is ebből a típusból kerültek ki. Első feleségétől, a modell Barbara Feltustól viharos jelenetek közepette vált el. Legutolsó vesztes wimbledoni játszmája után az orosz – algériai származású Angela Jermakovával keveredett futó viszonyba egy étteremben, amelynek következményeként megszületett kislánya, Anna 2000-ben. Becker nem ismerte el az apaságot, pedig a kislány megszólalásig hasonlít rá. Végül hivatalos DNS-vizsgálat támasztotta alá az apaságot.
A teniszező egy ideig Sabrina Setlur énekesnővel is járt.